Заново перекрывать крышу стоит денег, да и время на это уйдёт немало. Хотя, наверняка со временем встанет и такая проблема. А пока можно обойтись средствами подешевле. Здесь продают герметик для швов
https://spb.gflex.ru/. Им можно заделать все швы и щели в районе заплаток. Схватывается он намертво, но главное не пропускает влагу. Таким образом заплатки на крыши прослужат долго, до следующей смены кровельного материала.