как вариант:
1. gtk-window-decorator --replace
2. compiz --replace
3. sudo apt-get install emerald
4. Система - Параметры - Внешний вид, нажать вкладку Визуальные эффекты и выбрать Стандарт
ну и сменить обои, порой (по не известной причине
) тоже помогает.
Судя по посту второй пункт уже не нужен, хоть и хуже не будет. Третий пункт все же лучше сделать, а причина скорее всего в 1 пункте.
ИМХО вообще то лучше бы переустановить ОС (тем более что Убунта ставится быстро) так как удаление компиза тянет за собой много пакетов нужных для работы ОСи чем исправить его глюки если уж они выскочили.